مدل های فضایی بیزی ناپارامتری برای داده های ژنتیک جمعیت
thesis
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پایه
- author علی محمودی
- adviser مجید جعفری خالدی محمد حسین صنعتی
- publication year 1393
abstract
در چند دهه اخیر مطالعات زیستی و پزشکی در زمینه جمع¬آوری و تحلیل داده¬ها پیشرفت چشم¬گیری داشته است. پیش از این، مطالعات عمدتا ساده بودند به¬طوریکه بیشتر روی یافتن روابط بین چند متغیر تمرکز می¬کردند. اما با پیدایش ابزارهای بیوتکنولوژی، جمع¬آوری مقادیر زیاد اطلاعات برای موضوعات مورد مطالعه ممکن شد و آماردان¬ها نیز به دنبال روش¬های مناسب برای تحلیل این داده¬ها بودند. روش¬های آماری کلاسیک برای داده¬هایی با ساختار ساده¬تر قابل استفاده¬اند، اما رهیافت¬های آماری پیشرفته در مدل-سازی داده¬های پیچیده در زمینه¬های وسیعی از مطالعات، مورد نیاز است. یکی از مباحث مهم در حوزه زیست¬شناسی، ژنتیک جمعیت است. ژنتیک جمعیت به مطالعه جمعیت¬ها می¬پردازد و مطالعه تنوع ژنتیکی در این حوزه اهمیت زیادی دارد. لذا خوشه¬بندی افراد بسیار مورد نیاز است و لازم است برای این منظور از اطلاعات فضایی و ژنتیکی استفاده شود. در این پایان¬نامه با استفاده از رهیافت بیزی ناپارامتری برای این مسئله چاره اندیشی می¬شود و از یک مدل فضایی بیزی مبتنی بر پیشین فرایند دیریکله برای خوشه¬بندی افرا براساس اطلاعات فضایی و ژنتیکی به¬طور توأم استفاده می¬شود. لازم به ذکر است استنباط مدل به¬روش بیزی انجام می¬گیرد که در آن برای پارامترهای مدل توزیع پیشین اختیار شده و براساس روش¬های مونت¬کارلوی زنجیر مارکوفی از جمله الگوریتم گیبز و الگوریتم متراپولیس-هستینگز از توزیع پسین نمونه¬گیری می¬شود. در انتها نیز عملکرد مدل معرفی شده در یک مطالعه شبیه¬سازی و دو مثال کاربردی کربوط به داده¬های پستانداران مونتانا و هاپلوگروپ¬های کروموزوم y چند قومیت در ایران مورد بررسی قرار می¬گیرد.
similar resources
تلفیق بیزی مدل های قطعی و کریگیدن برای تحلیل داده های وابستۀ فضایی
برقراری پیوند میان سامانه اطلاعات مکانی و روشهای تصمیمگیری مرهون ابداع و تکامل روش تلفیق دادههای مکانی است. روشهای تلفیق اطلاعات، دادهها را با هدف دست یابی به نتیجۀ بهتر برای افزایش قابلیت تفسیر اطلاعات با یک دیگر ترکیب میکنند. در این مقاله روش تلفیق بیزی برای ترکیب اندازهها و خروجی مدلهای قطعی و کریگیدن بررسی شدند. سپس با استفاده از آن ها دادههای اُزن شهر تهران تحلیل شد و با ملاک میان...
full textمقایسه ای بین روش های ماکسیمم درستنمایی و بیزی برای برآورد پارامترهای سه مدل اقتصادسنجی فضایی
گاهی در اقتصادسنجی مشاهدات مورد مطالعه مستقل نیستند و وابستگی آنها ناشی از موقعیت قرار گرفتن مشاهدات در فضای مورد مطالعه است. برای تحلیل این نوع از دادهها از مدلهای رگرسیونی فضایی استفاده میشود. به دلیل وجود تعداد زیاد پارامتر در این مدلها، برای به دست آوردن برآوردهای ماکسیمم درستنمایی از الگوریتمهای تکرار شونده استفاده میشود که با مشکل پیچیدگی محاسبات مواجه است. علاوه بر این در مطالعات ...
full textمدل های خطرهای متناسب و شکنندگی برای تحلیل داده های بقای فضایی
مدل خطرهای متناسب کاکس یکی از پرکاربردترین مدلها برای برازاندن به داده های بقا است که بر اساس فرضهای همگنی جامعه، استقلال و هم توزیع بودن داده های بقا بنا شده است. اما در بسیاری از مواقع خطرهای واحدهای آماری متفاوت بوده و فرض همگنی جامعه برقرار نیست. یکی از دلایل این تفاوت وجود عوامل خطر ناشناخته یا مشاهده نشده است که لحاظ نکردن آنها و استفاده از مدلهایی همچون مدل خطرهای متناسب کاکس میتواند نتا...
full textآنالیز یک مدل ریاضی برای ژنتیک جمعیت
در این مقاله با استفاده از معادله پخش در مساله مقدار اولیه و مساله مقدار مرزی - اولیه و همچنین استناد به نظریه کلاسیک ژنتیک جمعیت، پدیده هایی مانند اثر آستانه ای و اطلاعات کیفی راجع به رفتار عمومی جوابهای معادله پخش برای مدلهای ژنتیکی بررسی می شود.
full textتحلیل بیزی مدل های شکنندگی در بررسی داده های بقا طولانی مدت
در تحلیل داده های بقا طولانی مدت دو دسته از مدل ها با نام مدلهای شفایافته آمیخته و ناآمیخته ارائه شدهاند. از آنجایی که استفاده از مدلهای شفایافته آمیخته در رویکرد بیزی دارای معایبی است، از جمله میتوان به عدم اطمینان از شناسایی پذیری بودن پارامترهای واقعی جامعه و همچنین ایجاد توزیع پسین ناسره به دلیل عدم انتخاب توزیعهای پیشین مناسب اشاره کرد. لذا در رویکرد بیزی از مدلهای ناآمیخته استفاد...
full textتحلیل بیزی تقریبی داده های فضایی – زمانی با استفاده از یک میدان تصادفی مارکوفی گاوسی
برای مدل بندی پاسخ های فضایی که در طول زمان مشاهده می شوند گاهی از مدل های سلسله مراتبی فضایی- زمانی استفاده می شود که در آن ساختار همبستگی فضایی –زمانی داده ها توسط یک میدان تصادفی پنهان گاوسی با تابع کوواریانس فضایی ماترن در نظر گرفته میشود. یکی از اهداف مهم در بررسی این مدلها برآورد پارامترها و متغیرهای پنهان و پیشگویی پاسخ ها در زمان های معلوم و موقعیت های معلوم فاقد مشاهده است. در این ...
full textMy Resources
document type: thesis
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پایه
Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023